Ngay sau kỳ họp thứ 8, Quốc hội khóa XI kết thúc, Bộ Công nghiệp đã có văn bản số 6755/BCN - KH ngày 12/12/2005 chỉ đạo Tổng công ty điện lực Việt Nam (EVN) làm việc với địa phương để xác định mức độ ô nhiễm và đền bù (nếu có); đồng thời  giao Cục kỹ thuật an toàn công nghiệp ( Bộ Công nghiệp) cùng EVN, nhà máy nhiệt điện Phả Lại ( nay là Công ty cổ phần nhiệt điện Phả Lại - gọi tắt là Công ty Phả Lại) phối hợp cùng các ban, ngành chức năng của tỉnh Hải Dương, Bắc Ninh tiến hành đo đạc, đánh giá ảnh hưởng môi trường của nhà máy tới các vùng dân cư xung quanh.

                Ngày 9/02/2006, tại cuộc họp giữa Công ty Phả Lại với đại diện các địa phương đã ghi nhận sự nỗ lực của Công ty Phả Lại trong công tác bảo vệ môi trường và sản xuất điện năng, góp phần đáp ứng nhu cầu dùng điện ngày một tăng của toàn xã hội . Theo kết luận của Sở Tài nguyên & Môi trường tỉnh Hải Dương thì từ năm 2000 trở lại đây, các chỉ số môi trường khói bụi đều nằm trong giới hạn cho phép. Tuy nhiên, theo đại diện Sở Tài nguyên & Môi trường tỉnh Bắc Giang, cuộc họp thống nhất sẽ tiến hành đo đạc đánh giá ảnh hưởng của khói bụi của Công ty Phả Lại vào đầu tháng 4, lúc có gió Đông Nam và lúc Công ty phát điện công suất ở mức cao. Vì vậy, trong 3 ngày từ ngày 31/3/2006 đến ngày 02/04/2006, Trung tâm Phân tích & Môi trường thuộc Hội Khoa học Kỹ thuật phân tích Hóa - Lý và Sinh học Việt Nam đã tổ chức khảo sát đo kiểm và lấy mẫu với sự giám sát của đại diện Sở Tài nguyên & Môi trường tỉnh Hải Dương, đại diện Sở Tài nguyên & Môi trường tỉnh Bắc Giang, đại diện Phòng Môi trường huyện Yên Dũng, đại diện Công ty Phả Lại và đại diện các xã có vị trí đo kiểm và lấy mẫu ( Tư Mại, Đồng Phúc, Đồng Việt thuộc huyện Yên Dũng). Đoàn đã tiến hành lấy mẫu tại 14 điểm ( mỗi điểm đo 3 lần) thuộc 3 xã trên. Cụ thể : xã Đồng Phúc: 05 điểm; xã Đồng Việt: 07 điểm; xã Tư Mại: 02 điểm.

          Các điều kiện thời tiết và kỹ thuật trong thời gian tiến hành đáp ứng yêu cầu    khảo sát (có gió Đông - Đông nam hoặc gió Đông nam, Công ty Phả Lại hoạt động cả 2 dây chuyền ở công suất cao và ổn định). Ngoài ra, trong thời gian tiến hành lấy mẫu và đo kiểm, có khoảng 40 lò gạch dọc theo các con đê phía giáp với Công ty Phả lại vẫn hoạt động nên khói bụi từ các lò gạch này tỏa ra cũng ảnh hưởng không nhỏ đến các khu dân cư phía cuối hướng gió, điển hình là các xã Đồng Phúc,Đồng Việt và Tư Mại. Tại một số gia đình như nhà ông Ngô Văn Sỹ - thôn Hạ Núi và nhà ông Phạm Văn Tiến thôn Trung còn chịu ảnh hưởng của các hoạt động giao thông và xây dựng khác.

           Tuy vậy, kết quả đo được cho thấy:

       - Các hơi khí độc CO, SO2, NOx tại thời điểm lấy mẫu đều có giá trị thấp hơn giới hạn cho phép.

       - Bụi lơ lửng tại các điểm sân UBND xã Đồng Việt, ngã ba sông Thương, đầu đê thôn Thượng, cạnh bến phà Tư Lãng xã Tư Mại và ngã ba đê thôn Nam Sơn có lúc có giá trị bằng, hoặc cao hơn một chút so với tiêu chuẩn. Nguyên nhân là do ảnh hưởng của các hoạt động giao thông, xây dựng công trình và của khói bụi các lò gạch xung quanh.

        - Tại điểm sân UBND xã Đồng Phúc và điểm đo tại gia đình ông Tiến (thôn Trung), ông Sỹ (thôn Hạ Núi), ông Tập (thôn Bè), ông Hảo (thôn Kim Chung)... các trị số về bụi lơ lửng đều nhỏ hơn giới hạn cho phép.

            Những kết quả trên đây cho thấy hoạt động sản xuất của Công ty Phả Lại hiện nay không gây ảnh hưởng rõ rệt đến chất lượng môi trường khu vực huyện Yên Dũng.

            Ngày 27/04/2006, Công ty Phả Lại đã tổ chức cuộc họp với sự tham gia của đại diện Cục Kỹ thuật an toàn công nghiệp, EVN, Sở Tài nguyên & Môi trường tỉnh Hải Dương, Sở Tài nguyên & Môi trường tỉnh Bắc Giang, đại diện UBND huyện Yên Dũng, đại diện UBND các xã Đồng Việt, Tư Mại, Đồng Phúc (huyện Yên Dũng) để thông báo kết quả đo kiểm đánh giá ảnh hưởng vừa qua. tại cuộc họp này, các bên đã thống nhất với kết quả đánh giá khảo sát môi trường tại các xã của huyện Yên Dũng, ghi nhận sự cố gắng của Công ty Phả Lại trong công tác bảo vệ môi trường, cơ bản các thông số môi trường nằm trong giới hạn cho phép. Các ý kiến của nhân dân 3 xã trên là ý kiến về môi trường trước năm 2000, nhưng cũng chưa có đầy đủ số liệu tại thời điểm đó để làm cơ sở pháp lý cho công tác đền bù thiệt hại môi trường.