Ngày 22/9/2006, Chính phủ đã ban hành Nghị định số 107/2006/NĐ-CP quy định xử lý trách nhiệm của người đứng đầu, cơ quan, tổ chức, đơn vị khi để xảy ra tham nhũng trong cơ quan, tổ chức, đơn vị do mình quản lý, phụ trách.

Theo đó, người đứng đầu, cấp phó của người đứng đầu cơ quan nhà nước, tổ chức chính trị, tổ chức chính trị - xã hội, đơn vị vũ trang nhân dân, đơn vị sự nghiệp, doanh nghiệp của nhà nước và cơ quan, tổ chức, đơn vị khác có sử dụng ngân sách, tài sản nhà nước nếu để xảy ra vụ, việc tham nhũng trong cơ quan, tổ chức, đơn vị do mình  quản lý, phụ trách thì tùy theo tính chất, mức độ của vụ việc sẽ bị xử lý kỷ luật bằng một trong các hình thức khiển trách, cảnh cáo, cách chức. Người đứng đầu, cấp phó của người đứng đầu tổ chức chính trị - xã hội – nghề nghiệp, tổ chức xã hội – nghề nghiệp , tổ chức xã hội thì bị xử lý kỷ luật theo quy định tại điều lệ của tổ chức đó. Người đứng đầu, cấp phó của người đứng đầu cơ quan, đơn vị là sĩ quan, hạ sĩ quan, quân nhân chuyên nghiệp trong quân đội nhân dân và công an nhân dân thì bị xử lý kỷ luật theo qui định của pháp luật đối với sĩ quan, hạ sĩ quan, quân nhân chuyên nghiệp trong quân đội và công an nhân dân.

Nghị định số 107/2006/NĐ-CP còn quy định các trường hợp được loại trừ trách nhiệm, miễn, giảm nhẹ hoặc tăng nặng hình thức kỷ luật; thẩm quyền, quy trình, thủ tục xử lý kỷ luật đối với người  đứng đầu, cấp phó của người đứng đầu đơn vị để xảy ra tham nhũng.